По данным обвинения, в качестве командира батальона Югославской народной армии (ЮНА) он руководил обстрелом этого города, объявленного ЮНЕСКО частью всемирного наследия. В результате были разрушены или повреждены многие исторические здания, убиты двое и ранено трое жителей города.
В апреле прошлого года судьи МТБЮ решили, что состояние Ковачевича не позволяет ему участвовать в судебном процессе. В то же время, трибунал счел, что в Сербии имеется возможность постоянно следить за здоровьем обвиняемого и провести суд над ним, если его состояние улучшится.
Судьи Гаагского трибунала приняли 17 ноября 2006 года решение о передаче его дела в Сербию.
Ковачевич — первый обвиняемый, дело которого будет передано в Сербию. Ранее МТБЮ передал девять обвиняемых в Боснию и Герцеговину и одно дело, в котором фигурируют двое обвиняемых, — в Хорватию.
Согласно решению СБ ООН, гаагский трибунал должен завершить рассмотрение всех дел первой инстанции в 2008 году и все процессы по апелляциям в 2010 году. Поэтому МТБЮ сосредоточился на судебном преследовании наиболее высокопоставленных обвиняемых, а дела лиц, не занимавших в ходе вооруженного конфликта в бывшей Югославии высокие посты, передает под юрисдикцию национальных судов государств, возникших на ее территории.
